טופז נוצר בדרך כלל בשלבים האחרונים של התקררות מאגמה גרניטית, בחללים ובעורקים שבהם יש גזים ונוזלים עשירים בפלואור. שם יש לגבישים מקום לגדול, ולכן נמצאו גבישי טופז גדולים מאוד, ששוקלים עשרות ואפילו מאות קילוגרמים.
למרות הקשיות, לטופז יש ביקוע מושלם לכיוון אחד: מכה חזקה בזווית הלא נכונה יכולה לפצל אותו לשניים, כמו עץ שמתבקע. רוב הטופז הכחול שרואים בחנויות היה במקור חסר צבע, וקיבל את צבעו בטיפול. בסולם מוס, טופז שורט קוורץ, וקורונדום שורט אותו. במשך מאות שנים קראו ״טופז״ כמעט לכל אבן צהובה, ורק בדיקות מדויקות הבדילו ביניהן.

