כמו כל קוורץ, אמטיסט קשה — 7 בסולם מוס — וגדל בגבישים משושים עם חוד. לעיתים קרובות הוא נמצא בתוך גיאודות: חללים עגולים בסלע, למשל בבזלת, שמים עם צורן מומס זרמו לתוכם במשך זמן רב, וגבישים צמחו מהקירות פנימה. כשחוצים גיאודה, היא נראית כמו מערה קטנה מלאה גבישים סגולים.
בחימום חזק או בחשיפה ארוכה לשמש, הסגול של האמטיסט יכול לדהות או להפוך לצהוב. אמטיסט שחומם הופך לפעמים לקוורץ צהוב שנקרא סיטרין. ״אחלמה״, אחת מאבני החושן בתנ״ך, מזוהה לפי חלק מהחוקרים עם אמטיסט.

