אף שהוא נמצא מתחת לאדמה ונראה כמו שורש, קנה השורש הוא גבעול: יש לו פרקים וניצנים, ומכל ניצן יכול לצמוח נבט חדש. הוא אוגר מזון ומאפשר לצמח להתפשט לצדדים.
לאירוסים, לנענע, לג׳ינג׳ר, לקנה, לבמבוק ולדשאים רבים יש קני שורש. לכן כתם נענע קטן הופך תוך שנה לכתם גדול — וקשה מאוד להוציא אותו מערוגה.
בגינון מרבים צמחים עם קני שורש בחלוקה: חותכים חתיכה עם ניצן ושורשים ושותלים במקום אחר. ומי שרוצה לעצור צמח מתפשט — שותל אותו בעציץ נפרד.

