מכתש איננו בור של מטאוריט או של הר געש. הוא נוצר כך: שכבת סלע קשה (גיר ודולומיט) כיסתה שכבות רכות של אבן חול. תנועות בקרום קימטו את האזור לקמר, בראשו נוצרו סדקים, ונחלים חדרו פנימה וסחפו החוצה את החול הרך — במשך מיליוני שנים. כך נשארה ״קערה״ עם קירות תלולים ונחל יציאה אחד, נחל רמון. בעולם יש מעט מכתשים כאלה, רובם בנגב ובסיני, והמילה העברית ״מכתש״ נכנסה לשפה המדעית.
בתחתית המכתש חשופים סלעים מתקופות רבות: אבני חול צבעוניות, בזלת של הרי געש קטנים, ״המנסרה״ — סלעים שנראים כמו לוחות עץ חתוכים — וקיר האמוניטים, עם מאובנים של רכיכות ים עתיקות. יעלים מסתובבים על השפה. בקיץ חם מאוד: מטיילים בבוקר, עם הרבה מים ובשבילים מסומנים בלבד.