השונית צמודה לחוף, ולכן אפשר לראות אותה בשנורקל כמה מטרים מהמים הרדודים. חיים בה מאות מיני דגים, ובהם דגי ליצן, דגי פרפר, דגי תוכי ודגי אריה, וגם תמנונים, צבי ים לפעמים ואלמוגים רבים. מדענים גילו שהאלמוגים של מפרץ אילת עמידים במיוחד לחום — כנראה בגלל ההיסטוריה שלהם מאז תקופת הקרח — והם נחקרים כ״תקווה״ לשוניות אחרות.
החלק המוגן ביותר הוא שמורת חוף האלמוגים של רשות הטבע והגנים, ויש באזור גם מצפה תת־ימי. השונית רגישה: לא נוגעים ולא עומדים על אלמוגים, לא מאכילים דגים, לא אוספים כלום, משתמשים בקרם הגנה שמתאים לים או בחולצת ים, ונכנסים רק בגשרי הכניסה ובמקומות המותרים, עם מבוגר.