שרידי נינוה נמצאים היום בצפון עיראק, ליד העיר מוסול. בימי קדם הייתה נינוה אחת הערים הגדולות בעולם, ובספר יונה היא נקראת ״העיר הגדולה״. לפי ספר יונה, חיו בה יותר ממאה ועשרים אלף איש, וגם בעלי חיים רבים.
לפי הסיפור, יונה ברח מהשליחות, נבלע בדג גדול ובסוף הגיע לנינוה והכריז שהעיר תיהפך. אנשי נינוה, מהמלך ועד אחרון התושבים, צמו, לבשו שק וחזרו מדרכם הרעה — ואלוהים סלח להם. יונה כעס, ובסיפור הקיקיון למד שאלוהים מרחם על כל בריותיו, גם על אנשי עיר זרה.
בספר נחום, שהוא חלק מתרי עשר, יש נבואה על נפילת נינוה. מבחינה היסטורית, נינוה נכבשה והוחרבה בסוף המאה השביעית לפני הספירה. בבית הכנסת קוראים את ספר יונה ביום הכיפורים, בגלל המסר על תשובה וסליחה.