הפרוטוצרטופס הוא אחד הדינוזאורים הנפוצים ביותר במדבר גובי. נמצאו ממנו מאות שלדים, מגוזלים ועד מבוגרים, ולכן החוקרים יכולים לראות איך הגוף השתנה עם הגיל — למשל איך הצווארון גדל והתרחב.
הוא מפורסם במיוחד בזכות מאובן ״הדינוזאורים הלוחמים״, שבו הוא נאבק בוולוצירפטור. יש גם השערה שגולגולות של פרוטוצרטופס שנמצאו בעבר במדבר השפיעו על אגדות על הגריפון, יצור דמיוני עם מקור של עוף וגוף של אריה. זו השערה מעניינת, אבל לא מוכחת.
במדבר גובי נמצאו גם קינים של פרוטוצרטופס עם גוזלים. מחקר על עוברים בביצים שלו הציע שהקליפה הייתה רכה, כמו של צבים מסוימים — ולא קשה כמו של ציפורים. גם הרעיון הזה עדיין נבדק.